Com o objetivo de auxiliar as atividades da igreja em áreas específicas, a Primeira Igreja Presbiteriana de Curitiba tem alguns departamentos. São eles: Conselho da Igreja, EBD (Escola Bíblica Dominical), Música, Comunicação, Depto Missionário.

Cada um destes departamentos tem suas funções descritas em seus próprios nomes, mas é possível verificar suas definições e atividades e suas páginas.